Prediction of common secondary structures of RNAs: a genetic algorithm approach
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Prediction of common secondary structures of RNAs: a genetic algorithm approach.
In this study we apply a genetic algorithm to a set of RNA sequences to find common RNA secondary structures. Our method is a three-step procedure. At the first stage of the procedure for each sequence, a genetic algorithm is used to optimize the structures in a population to a certain degree of stability. In this step, the free energy of a structure is the fitness criterion for the algorithm. ...
متن کاملPrediction of common folding structures of homologous RNAs.
We have developed an algorithm and a computer program for simultaneously folding homologous RNA sequences. Given an alignment of M homologous sequences of length N, the program performs phylogenetic comparative analysis and predicts a common secondary structure conserved in the sequences. When the structure is not uniquely determined, it infers multiple structures which appear most plausible. T...
متن کاملinvestigating the feasibility of a proposed model for geometric design of deployable arch structures
deployable scissor type structures are composed of the so-called scissor-like elements (sles), which are connected to each other at an intermediate point through a pivotal connection and allow them to be folded into a compact bundle for storage or transport. several sles are connected to each other in order to form units with regular polygonal plan views. the sides and radii of the polygons are...
the effect of a selfregulatory approach on the improvement of efl learners listening comprehension
تاثیر آموزش مهارت خود محوری بر روی ارتقاء مهارت شنیداری زبان آموزان هدف این پژوهش بررسی عوامل موثر در ارتقا مهارت شنیداری زبان آموزان ایرانی بود. در مرحله اول این تحقیق پژوهشگر پس از انجام مصاحبه نود زبان آموز را با استفاده از تست ایلتس انتخاب شدند. برای بررسی عوامل عوامل موثر در ارتقا مهارت شنیداری زبان آموزان ایرانی از دو نوع فیلم ویرایش شده و ویرایش نشده استفاده گردید.برای انجام تح...
network of phonological rules in lori dialect of andimeshk: a study within the framework of post-generative approach.
پژوهش حاضر ارائه ی توصیفی است از نظام آوایی گویش لری شهر اندیمشک، واقع در شمال غربی استان خوزستان. چهارچوب نظری این پژوهش، انگاره ی پسازایشی جزءمستقل می باشد. این پایان نامه شامل موارد زیر است: -توصیف آواهای این گویش به صورت آواشناسی سنتی و در قالب مختصه های زایشی ممیز، همراه با آوانوشته ی تفصیلی؛ -توصیف نظام آوایی گویش لری و قواعد واجی آن در چهارچوب انگاره ی پسازایشی جزءمستقل و معرفی برهم کن...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Nucleic Acids Research
سال: 2000
ISSN: 1362-4962
DOI: 10.1093/nar/28.4.991